全面预算管理极大的推动了现代企业的成熟与发展,是企业内部管理控制的一种重要手段。从20世纪20年代在美国的杜邦、通用电气公司产生以来,迅速发展为大型企业的标准作业流程,成效较为显著。我国企业积极借鉴西方经验,开始推行全面预算工作,全面预算管理成为企业管理控制、决策支持、战略实施、资源配置的重要工具。将企业全面预算管理的经验应用于科研事业单位的管控过程中,是一个非常重要的创新举措。然而如何结合科研事业单位自身的特点实现全面预算管理的作用最大化,是一个难题。本文将探讨科研事业单位全面预算管理存在的问题,并提出相应的解决方法。