采用荧光AFLP技术,对所收集的22个红花檵木材料和变异类型进行分类与亲缘关系研究.从64对引物组合中筛选出8对引物组合进行扩增,共扩增出1226条带,多态条带1085条,多态性比率为88.5%.冬艳紫红、大圆叶双面红的多态性比率最高,达100%,其同源性最低.基于AFLP分析的UPGMA聚类分析得到,供试材料的遗传相似系数为0.7442~0.9207.以0.8171的相似系数为阈值,所有供试材料被分为6大组群,第一组群内以0.8484为阈值,又可分为4组.通过AFLP标记发现冬艳红5个类型中冬艳玫红、冬艳亮红、冬艳卷瓣玫聚类在一起,冬艳紫红、冬艳卷瓣红与其他类型存在的遗传差异通过分子标记可以鉴定出来.通过标记发现大圆叶双面红并没有与大叶玫红、大叶红、大叶卷瓣红、大红伏划分在双面红类型中,其外部形态相似,但遗传距离有较大差异.与形态标记相比,基于AFLP标记的红花檵木分类体系更能反映红花檵木品种间的亲缘关系.